Junto con la Dirección de Recursos Naturales y Fiscalización de la provincia de Entre Ríos, Prefectura mantiene un esquema operativo con despliegue de personal y medios, permanente, en todo el ámbito jurisdiccional.
En este marco entre los kilómetros 349 y 340.2 del Margen Derecha (MD) río Uruguay, se están desarrollando múltiples operativos de manera conjunta entre efectivos de la Prefectura Represa Salto Grande, e Inspectores de Fiscalización para prevenir y disuadir la pesca ilegal en el río Uruguay a fin de evitar la depredación de las especies.
Se aclara que, si bien los controles están destinados al cumplimiento de normas reglamentarias y documentación exigible por la Prefectura Naval Argentina, la Dirección de Fiscalización solicita Licencia Anual de Pesca Deportiva a los ciudadanos que se hallan realizando actividades de pesca deportiva en aguas del río Uruguay.